Op 1 december 2014 trad een samenwerkingsovereenkomst in werking tussen enerzijds de afdeling Mestbank van de Vlaamse Landmaatschappij en anderzijds de Rijksdienst voor Ondernemend Nederland, waaronder de Voedsel- en Warenautoriteit ressorteert. Die overeenkomst regelt de gegevensuitwisseling van mesttransporten tussen Vlaanderen en Nederland.
Inspecteurs in Nederland en Vlaanderen plannen samen een gerichte controleactie op grensoverschrijdende mesttransporten bij de start van het nieuwe bemestingsseizoen in februari 2015. De controleactie kadert in een geheel van gerichte en verscherpte controles de volgende jaren met het doel om de waterkwaliteit verder te verbeteren.
Export van mest is een belangrijke pijler in het mestdecreet. Het Vlaamse mestbeleid staat voor een duurzame export van mest. Nog te vaak stellen inspecteurs van de Mestbank onregelmatigheden vast bij de verhandeling en het transport van mest, ook van grensoverschrijdende mesttransporten met Nederland. Sinds 1 december 2014 wisselen de Vlaamse Mestbank en de Nederlandse Voedsel- en Warenautoriteit dan ook gegevens uit over mesttransporten en mestverhandelingen tussen Nederland en Vlaanderen en omgekeerd.